Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PADI1Q9ULC6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms