Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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