Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNL1Q9UK58 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms