Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms