Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMPXQ9UHP9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms