Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms