Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLKQ9UBT6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms