Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms