Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms