Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms