Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms