Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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