Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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