Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSD3Q9NYI0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSD3Q9NYI0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSD3Q9NYI0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSD3Q9NYI0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSD3Q9NYI0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSD3Q9NYI0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms