Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms