Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX1Q9NSU2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms