Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms