Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms