Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRA1Q9HD15 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms