Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms