Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms