Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms