Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms