Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms