Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB6Q9BUF5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms