Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TINF2Q9BSI4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms