Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDHD3Q9BSH5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDHD3Q9BSH5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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