Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R4Q99570 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms