Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGMNQ99538 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGMNQ99538 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms