Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms