Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms