Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms