Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms