Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCG3Q8WXD2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCG3Q8WXD2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms