Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM35BQ8NCS4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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