Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD12Q8N8I0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms