Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD35Q8N283 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms