Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC80Q76M96 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms