Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDC4Q6P2E9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms