Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms