Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP170Q5SW79 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP170Q5SW79 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms