Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms