Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms