Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP41Q3LFD5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP41Q3LFD5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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