Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF3Q3KNV8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms