Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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