Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYPL1Q16563 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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