Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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