Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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