Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms